Crossed LMM (Çapraz Random Karma Model)

Crossed LMM (Çapraz Random Karma Model)

⚡ İleri Düzey · Karma Modeller · Crossed

v1.0.1

Ziraat, Orman ve Su Ürünleri bağlamı — iki random faktör nested DEĞİL, crossed (çapraz). puanlama ~ 1 + (1|hakemci_islah) + (1|genotip). Her hakemci_islah tüm genotip‘lerle eşlenir.

Crossed random2 faktörREMLInter-rater reliability

🎯 Ne işe yarar?

Klasik nested yapıdan farklı: her hakemci_islah farklı genotip’lerle bağımsız olarak çiftleşir (her genotip her hakemci_islah altında değil; karışık). Ziraat, Orman ve Su Ürünleri’nde iki etkenin random varyansını ayrı tahmin eder.

📌 Ne zaman kullanılır?

  • Hakem × değerlendirilen (her hakem her örneği değerlendirir)
  • Operatör × cihaz (her operatör her cihazı kullanır)
  • İki random etkili ölçüm tasarımı

⚙ Varsayımlar

  1. İki random faktör birbirinden bağımsız (nested değil).
  2. Her (hakemci_islah, genotip) hücresinde ≥1 gözlem (boş hücreler tahmini etkiler).
  3. Random etkiler ~ Normal(0, σ²).

📊 MerQur’da Nasıl Çalıştırılır?

1
Veri yükle.
2
Analiz → ⚡ İleri Düzey → Crossed LMM.
3

Panel atamaları (programdaki form alanları):

  • Bağımlı Değişken: deger
  • Faktör A: faktor_a
  • Faktör B: faktor_b
  • A Tipi: random
  • B Tipi: random
  • SS Tipi: 1
4
Estimator: REML.
5
▶ Çalıştır. σ²hakemci_islah, σ²genotip, σ²residual + ICC.

📊 Örnek Veri Seti — Ziraat, Orman ve Su Ürünleri

ℹ Not: Aşağıdaki senaryo, MerQur çıktısı ve yorum, gerçek örnek veri seti MerQur’da çalıştırılarak elde edilmiştir. Kendi verinizdeki sayısal sonuçlar farklılık gösterecektir; buradaki amaç analizin uçtan uca nasıl kurgulandığını ve yorumlandığını göstermektir.

🎬 Örnek Dosya

Bu analiz, Ziraat, Orman ve Su Ürünleri alanına ait aşağıdaki örnek veri seti üzerinden gösterilmiştir:

Ziraat_Orman_Su/109_crossed_lmm_A_B.xlsx

🎬 Senaryo

İki rastgele faktörün (factor_a, factor_b) çaprazlandığı (her A seviyesinin her B seviyesiyle eşleştiği) bir tasarımda sonucu (value) modelliyoruz (örneğin her genotipin her lokasyonda denenmesi). Çaprazlanmış LMM, A ve B’yi çaprazlanmış rastgele etkiler olarak alır; böylece hem genotip hem lokasyon kaynaklı değişkenliği aynı anda modelleyip arı tahminler verir.

⚙️ Değişken Seçimi

  • Bağımlı (sürekli): value
  • Çaprazlanmış rastgele etkiler: factor_a, factor_b

Veri Önizleme (İlk 5 Satır)

factor_a factor_b value
A1 B1 53.8
A1 B1 55.31
A1 B1 50.68
A1 B1 55.81
A1 B1 56.05

n = 128 · Sütunlar: factor_a, factor_b, value

📈 MerQur Çıktısı

CROSSED LMM (ÇAPRAZ RANDOM KARMA MODEL) SONUCU
─────────────────────────────────────────────

factor_a (random): F(3) = 0.38, p = 0.767 ns | value ~ factor_a + factor_b (çaprazlanmış random)

💬 MerQur Yorumu

İki rastgele faktörün çaprazlandığı (her A seviyesinin her B seviyesiyle eşleştiği) bir tasarımda sonucu modelledik (örneğin her genotipin her lokasyonda denenmesi). Çaprazlanmış LMM, A ve B’yi çaprazlanmış rastgele etkiler olarak alır; böylece hem genotip hem lokasyon kaynaklı değişkenliği aynı anda modeller. Sonuç: faktör A anlamlı değil (F(3) = 0.38, p = 0.77); yani bu faktörün seviyeleri arasında kayda değer bir fark yok. Anlamsızlık da bir bulgudur: A faktörünün sonuca katkısı ihmal edilebilir düzeydedir. Çaprazlanmış tasarımlar yuvalanmış tasarımlardan farklıdır: burada A ve B bağımsız olarak çapraz düzenlenmiştir (her kombinasyon mevcuttur), yuvalanmış tasarımda ise alt faktör üst faktöre gömülüdür. Doğru model, tasarımın gerçek yapısına bağlıdır.

⚠ Sık Hatalar

  • Nested yapı varken crossed tanımlamak — her (hakemci_islah, genotip) çiftinin gerçekten bağımsız olduğundan emin olun.
  • Çok seyrek matris (hakemci_islah×genotip’de boş hücre çok) — fit yapılamaz veya unstable.
  • hakemci_islah-ICC düşük + genotip-ICC yüksekse genotip’nin tahmininde shrinkage daha sıkı.

📚 MerQur’a Atıf

Örücü, Ö. K. (2026). MerQur: Bütünleşik Akademik Veri Analizi ve Raporlama Platformu [Bilgisayar Yazılımı] (Sürüm 1.0.0). https://doi.org/10.53463/merqur.2026001

Tüm atıf formatları →

📝 Üretim Notu — Bu sayfadaki örnek veri sentetik olarak üretilmiştir (sabit SEED=42, generator: samples/Ileri_Duzey_v102/_generate_v102_datasets.py). Sayfa içeriği Anthropic Claude desteği ile hazırlanmış, akademik doğruluk yazar tarafından kontrol edilmiştir.